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다온비에스와 함께하는 Partners를 소개합니다.

Microscoop® Mint

Microscoop® Mint는 고해상도 광학 이미징 기술을 기반으로 특정 세포 또는 소기관 영역을 실시간으로 시각화하고, 선택적으로 단백질을 표지할 수 있는 정밀한 라벨링 기법입니다. 이 기술은 이광자(two-photon) 레이저를 이용해 관심 부위에만 국소적으로 빛을 조사하고, 광반응성 바이오틴(biotin) 유도체를 활성화시켜 해당 영역 내 단백질에만 선택적으로 결합시킵니다. 이를 통해 공간적으로 정밀한 단백질 라벨링이 가능하며, 후속 질량분석에서 고특이적 단백질 동정 및 정량이 가능합니다.

제품특징

  • Unbiased proteomic discovery: 항체나 타겟 패널 없이 전 샘플 단백체 분석
  • High resolution (350 nm): subcellular 수준의 정밀 해상도
  • Superior sensitivity: 저발현 단백질 검출 가능
  • Unmatched specificity: 2-photon 유도 라벨링으로 관심 영역 단백질만 분석
  • Broad sample compatibility: FFPE, fresh frozen 조직 및 고정 세포 모두 사용 가능
  • Mass spectrometry ready: 질량 분석을 위한 최적의 샘플 전처리 제공
기존 분석법의 한계를 Syncell의 Microscoop®/Mint로 극복해 보세요!

A. 항체 기반 공간 단백체 분석 (Antibody-Based Spatial Proteomics)



  • 가설 중심 접근: 사전 타깃 단백질에 대한 정보가 필요하여, 탐색 기반 연구에는 제한적입니다.
  • 복잡한 실험 과정: 항체의 농도 최적화, 풀링, 결합 과정이 시간과 비용을 크게 증가시킵니다.
  • 멀티플렉싱 한계: 동시에 검출할 수 있는 단백질 수가 제한되어 분석 깊이와 범위가 낮습니다.
  • 데이터 해석 어려움: 소프트웨어 및 영상 알고리즘의 제약으로 인해 항체 위치 정보의 정확한 해석이 어렵습니다.

B. Proximity Labeling 기법



  • 모델 시스템 제한: 대부분 in vitro 또는 마우스 모델에서만 가능하며, 직접적인 인체 조직 적용은 불가능합니다.
  • 공간 분해능 부족: 세포 내 여러 위치(예: 핵과 세포질)의 단백질 분포 차이를 분리해내기 어렵습니다.
  • 수작업 중심의 Workflow: 높은 노동 집약도로 인해 효율성이 낮고 자동화가 어렵습니다.
  • 비특이적 결합 문제: 비특이적 단백질 표지가 많아 데이터 정확도가 낮아질 수 있습니다.

C. 레이저 캡처 미세절개술 (Laser Capture Microdissection, LCM)



  • 공간 해상도 제한: XY 해상도(~200 nm) 및 Z 해상도(3–20 μm)는 소기관(예: 핵소체, 스트레스 과립, 일차 섬모) 수준 분석에 부적합합니다.
  • Z-축 분해능 저하: Z축 해상도가 낮아 소형 구조물 분석 시 비특이적 수집 가능성이 높습니다.
  • 낮은 처리량: 최적화하더라도 시간당 약 100개 세포 분리가 한계이며, 대규모 연구에 적합하지 않습니다.
  • 응용 제약: 해상도 및 처리량 한계로 인해 정밀도 높은 연구 및 대규모 프로젝트에는 활용이 어렵습니다.

MICROSCOOP® 워크플로우

1. 실시간 이미지 분석 및 ROI 지정
  • 고정된 세포(fixed, frozen) 또는 조직(FFPE, fresh frozen, PFA/Methanol fixed) 샘플에 형광 마커 염색
  • 연구자가 관심 영역(ROI)을 크기, 모양, 강도 등을 기준으로 수동 지정
  • Microscoop Autoscoop 소프트웨어가 ROI를 이미지 마스크로 변환
  • 이미지 마스크는 전체 샘플에 적용되어 레이저 타겟팅의 기준이 됨

2. 패턴 기반 광바이오틴화
  • Synlight-Rich™ 키트의 광바이오틴 시약을 전체 샘플에 적용
  • Femtosecond 레이저가 ROI를 픽셀 단위로 조사해 단백질을 정밀 표지
  • 수백~수천 개 FOV를 자동 반복 처리
  • 라벨링된 단백질을 충분히 확보하기 위한 집적 방식


3. 단백질 추출 및 정제
  • 슬라이드 또는 챔버에서 전체 샘플 내용물 수집
  • 여러 샘플을 pooling하여 단백질 총량 확보 가능
  • Synpull™ 키트로 세포 용해 → 바이오틴화 단백질 면역침강 → 펩타이드 분해

4. 단백체 확인 및 분석
  • LC-MS/MS 기반의 비편향적 proteomic analysis 분석 수행
  • 라벨링/비라벨링 샘플 비교를 통해 위치 특이적 단백체 도출
  • 면역염색, 추가 분석으로 검증 가능
  • 차등 발현, 질병 vs 정상 비교, PTM 분석 등 다양한 후속 해석 가능

Literature

  • Syncell의 Microscoop® Mint는 현미경, 광바이오틴화, 질량분석 기술을 결합해 고해상도로 단백질을 정확하게 찾아내는 장비입니다.

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