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TAPS+

TAPS+는 메틸화된 cytosine(5mC/5hmC)을 선택적으로 thymine으로 전환하는 효소 기반 methylation sequencing 기술입니다.

기존 bisulfite 방식과 달리 메틸화되지 않은 cytosine이 아닌 메틸화된 염기를 직접 변환하는 positive-readout 방식을 사용합니다. 이를 통해 DNA 손상을 최소화하고 높은 sequence diversity를 유지하여, 하나의 library에서 methylation 정보와 SNV/Indel, CNV 등 유전체 변이를 함께 분석할 수 있습니다.

또한 FFPE, cfDNA 및 1 ng 수준의 low-input sample에서도 안정적인 library preparation과 methylation analysis를 지원하여, 임상 연구에서 활용되는 제한적이거나 손상된 sample에도 적용할 수 있습니다.

제품 특징

기존 Bisulfite 방식과의 차이

DNA methylation 분석에는 전통적으로 bisulfite conversion 방식이 널리 사용되어 왔습니다. Bisulfite 방식은 메틸화되지 않은 cytosine을 thymine으로 전환하여 methylation 여부를 구분합니다.

하지만 이 과정에서 DNA 손상이 발생할 수 있으며, cytosine의 광범위한 변환으로 sequence diversity가 감소하여 mapping efficiency와 coverage에 영향을 줄 수 있습니다. 또한 methylation 정보와 유전체 변이를 하나의 데이터에서 함께 분석하는 데 제한이 있습니다.


TAPS+는 반대로 5mC/5hmC만 선택적으로 변환하여 원래 DNA sequence의 복잡성을 최대한 유지합니다. 이를 통해 보다 효율적인 sequencing과 methylation 및 genetic variant의 통합 분석을 지원합니다.


주요 특장점

  • 하나의 library에서 methylation + SNV/Indel/CNV 동시 분석
  • 98% 이상의 5mC conversion으로 높은 methylation detection 정확도
  • 높은 sequence diversity로 mappability와 CpG coverage 향상
  • FFPE, cfDNA, low-input sample(1 ng) 지원
  • 약 6시간의 automation-friendly workflow
  • 분석 시간 30% 이상 단축 및 computational cost 절감

DATA

TAPS+가 제공하는 새로운 methylation 분석


⊙ 메틸화와 유전체 변이 동시 분석

높은 sequence diversity를 유지하여 genome mapping efficiency를 높이고, 하나의 library에서 methylation과 함께 SNV, Indel, CNV 등 다양한 유전체 변이를 분석할 수 있습니다.



그림설명. 높은 base diversity를 유지하여 하나의 library에서 정확도 높은 methylation 분석과 SNV detection을 동시에 수행할 수 있습니다.

⊙ 높은 데이터 정확도
DNA 손상을 최소화하고 methylated cytosine을 선택적으로 변환하여 sequencing artifact와 false positive 발생을 줄이고 보다 신뢰도 높은 methylation analysis를 지원합니다.


그림설명. TAPS+는 DNA 손상을 최소화하여 sequencing artifact와 false positive를 줄이고 높은 분석 신뢰도를 제공합니다.

⊙ 임상 연구 샘플에 적합
TAPS+는 FFPE, cfDNA와 같이 손상되거나 확보량이 제한적인 sample에서도 안정적인 library preparation과 methylation analysis를 지원합니다.


그림설명. FFPE sample의 quality variation에도 안정적인 데이터를 확보할 수 있으며, cfDNA와 같은 민감한 sample에서도 DNA 손상을 최소화하면서 library를 구축할 수 있습니다.

⊙ 효율적이고 automation-friendly한 workflow
TAPS+는 기존 bisulfite conversion 방식 대비 간소화된 workflow를 통해 sample handling 부담을 줄이고, 약 6시간 내 library preparation을 완료할 수 있습니다. 또한 automation workflow에 적용하기 용이하도록 설계되어 대량 sample 처리에도 효율적으로 활용할 수 있습니다.


그림설명. 간소화된 single-day workflow로 sample handling 부담을 줄이고 automation 적용을 효율적으로 지원합니다.


Literature

#TAPS

#DNALibrary

#DNA

#BisulfiteFree

#Sequencing

#LibraryPrep