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Spatial Proteomics

다온비에스 · 2025.05.22 · 709
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Spatial proteomics는 Nature methods의 “Method of the year 2024”로 선정된 만큼 주목받는 분야입니다.
Syncell의 MICROSCOOP® Mint는 현미경으로 이미징한 샘플에서 선택한 ROI(region of interest)의 protein을 추출하여, spatial proteomic discovery를 위한 솔루션을 제공합니다.

[MICROSCOOP®]
기존의 단백체 분석 기술은 특정 미세 환경에 존재하는 단백질만을 온전히 분리해내는 데 한계가 있었습니다. MICROSCOOP은 현미경 이미지상에서 확인되는 관심 영역(ROI)을 지정한 후, 해당 위치의 단백질만을 선택적이고 정밀하게(25nm+) 광표지(Labeling)하여 질량분석(MS)으로 연결합니다.

*핵심 장점: Cell-to-cell contact site나 cell surface 등 기존 기술로는 분리하여 분석하기 까다로웠던 타겟에 정밀하게 접근할 수 있어, 그동안 한계가 있었던 영역의 연구를 가능하게 합니다. 

1. 주요 특장점
  • Unbiased Discovery: 특정 항체나 사전 설정된 패널에 의존하지 않고, 관심 영역(ROI) 내의 모든 단백질 정보를 추출합니다.
  • 초고해상도 및 특이성: Two-photon 레이저를 통한 subcellular 수준의 정밀한 photo-biotinylation으로 타겟 영역의 단백질만 정확하게 표지합니다.
  • 광범위한 샘플 호환성: 고정된 세포는 물론 FFPE 및 Fresh frozen 조직 샘플에서도 완벽하게 작동하여 보존된 임상 샘플 연구에 최적화되어 있습니다.
2. 분석 워크플로우

 
[Synlight Photolabeling Kits] 
연구 목적과 요구되는 해상도에 따라 두 가지 라인업으로 제공되어 맞춤형 연구가 가능합니다.

 구분

 Synlight-Rich

 Synlight-Pure

 핵심 기능

 특정 마커가 없는 영역에도 사용 가능

 항체 매개 근접 광표지 기술을 결합하여 광학적 한계를 뛰어넘는 나노 스케일의 표지

 유효 해상도

 ~350 nm (xy축) / 1.5 µm (z축)

 25 nm 표지 정밀도

 주요 장점

 사전 지식이나 타겟 마커 없이도 새로운 단백체를 발굴(Discovery)하는데 이상적

 Proximity labeling의 한계를 넘어 극미세 영역의 분자 상호작용까지 높은 특이성으로 규명

 주용 적용 분야

 Whole Cell Proteome, Cell-Cell Interactions, 

 Larger Compartments/Organelles, Target Free Proteomics

 Smaller Compartments/Organelles, Protein-Protein Interactions, 

 Protein Complex Mapping, Microdomain Proteomics, Inter-Organelle Proteomics)


[Synpull Enrichment Kit] 

광표지 단계 이후, 바이오틴화된 단백질을 고효율로 회수 후 LC-MS/MS의 진행을 위해 특수 제작된 정제 키트입니다.

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