10X Genomics

Xenium In Situ Analyzer는 한번의 실험으로 조직 샘플내 400여개의 RNA 마커를 동시에 자동적으로 이미지화하고 분석하는 시스템입니다. 조직 내 원하는 RNA 전사체의 세포내 위치 및 발현량을 시각적으로 이미지화하고 이를 분석하는 할 수 있습니다. 현미경을 이용하여 각 분석체를 시각화하며, NGS 기반의 Visium spatial output보다 높은 해상도로 분석할 수 있습니다.

Expertly curated and easily customizable content

Easy-to-use, high-throughput analyzer

Intuitive visualization software

High-performance in situ gene expression mapping

• Fully automated, single molecule RNA and protein^* detection
*Protein capability expected after initial commercial availability
• Compatible with FFPE or fresh frozen tissues
• Curated panels, plus added custom targets,make getting started easier and faster
• Run up to 12 sections^† per week at subcellular resolution
†When each section is 1 cm x 1 cm
• Data ready for visualization and analysis with 10x Genomics software
• Dedicated spatial experts

Chromium Single Cell Gene Expression Flex은 시간 제약없이 대량의 샘플에 대한 단일 세포 유전자 발현 정보를 분석할 수 있습니다. Chromium Single Cell Gene Expression Flex는 FF, PFA-fixed 및 FFPE 조직 모두에 적용되며, 간소화된 워크플로우를 제공하여 단계별 실험 변수를 줄여 분석효율을 극대화할 수 있습니다.

• Download Product Sheet
• More Information

인간 또는 마우스 검체에서 분리한 세포를 고정하여 깨지기 쉬운 세포들을 원하는 시점까지 안정적으로 보존

샘플 수집, 준비 및 처리 단계를 개선하여 단일세포 실험 과정을 간소화

데이터의 손상없이 보관된 샘플을 일괄 및 다중 처리(multiplexing) 할 수 있기에, 단계별 실험 변수를 줄여 분석 효율을 극대화

단일세포 수준에서의 유전적 발현 및 세포 표면 단백질 정보를 동시에 높은 민감도로 분석

샘플을 분석 센터(service provider)로 보내거나, 중앙 검사실(core lab)을 이용하고자 할때 유용

채널당 최대 16개의 샘플을 다중(multiplexing)으로 프로파일링하여 샘플당 처리 비용을 대폭 절감

Chromium Single Cell Gene Expression Solution은 수 백에서 수만 개의 세포를 대상으로 세포 특성 분석 및 유전자 발현 프로파일링을 위한 포괄적이고 확장 가능한 솔루션을 제공합니다. 최근 기술 진보를 통해 이전보다 향상된 세포당 unique transcript를 detection 할 수 있게 되었습니다.

Feature Barcoding 기술이 새로이 접목되면서, 세포 특이적인 CRISPR-mediated perturbations 의 식별과 함께, 동일 세포에서 cell surface protein expression과 gene expression 정보를 동시에 측정할 있게 되는 등 분자수준에서 완전한 판독 정보를 얻을 수 있습니다. 또한 추가적인 feature type 추가의 가능성 면에서 제한이 없습니다.

Chromium 기술은 전통적인 유전자 발현 분석을 뛰어 넘어 Cell populations, Cell type, Cell states 등 세포 별 분석에 기초한 광범위한 연구를 가능케 하고 있으며, 그 적용점은 Tumor heterogenity와 stem cell composition 으로 부터 dissecting neuronal population 까지 다양합니다. Chromium Single Cell Gene Expression Solution은 단일 세포로 부터 complexity library 제작을 위한 최적의 solution과 함께 Turnkey Software를 제공함으로써 어떤 샘플 유형이든 그에 대한 통찰력을 극대화할 수 있습니다.

Identify and characterize rare cell types

Analyze and understand cellular heterogeneity and how this contributes to your biological system

Perform cellular phenotyping with single cell RNA-seq to identify novel targets, biomarkers, and cell types and states without the need for pre-selected targets

Evaluate mRNA and cell surface protein expression profiles within the same cell

Perform high-throughput and high-resolution functional genetic screens in tens of thousands of cells simultaneously

Assess comprehensive gene expression phenotypes for individual CRISPR perturbations

• Partition 100 – 80,000+ cells efficiently
• Superior sensitivity and cell capture rate up to 65%
• Simple workflow
• Cell size flexibility, no lower limits
• Low doublet rates of under 0.9% in 1,000 cells
  Available with Next GEM technology

Chromium immune profiing solution은 마우스와 인간으로 부터 유래된 수백에서 수만 개의 T 세포 및 B 세포를 cell by cell 수준에서 adaptive immune response와 immune repertoires를 세포적 맥락에서 연구하기 위한 포괄적 접근tool입니다. 여기에  Feature Barcoding 기술을 추가하면, 세포표면 마커와 항원 특이성과 같은 추가적인 세포 판독 정보를 탐지하여 이를 분석할 수 있으므로 immune cell phenotyping을 개선하고 림프구와 표적 세포 사이의 동적 상호 작용을 연구하는 것이 가능합니다.

간단한 워크 플로우만으로 샘플에서 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 소프트웨어 분석이 가능하며 T 및 B 세포 다양성, V (D) J 재조합 및 면역 세포 프로파일 링에 대한 다앙한 정보를 생산할 수 있습니다.

Immune profiling과 Feature barcoding solution은 특히 면역학 및 면역 종양학 연구뿐아니라 감염병 연구 등 다양한 연구에 있어 adaptive immune system를 이해를 위한 기술로서 면역분야 연구의 가속화에 기여할 것입니다.

Reveal clonality, diversity, antigen specificity, and cellular context

Assemble and annotate full-length V(D)J gene sequences

Pair α and β chain TCR sequences from individual T cells

Pair heavy and light chain immunoglobulin (Ig) sequences from individual B cells with full isotype resolution

Simultaneously measure TCR, B cell Ig, cell surface protein expression, and 5’ gene expression in the same cells

Link full-length, paired TCR α and β chain sequences with TCR-pMHC specificity

Simultaneously measure cell surface protein expression with gene expression

• Partition 100 – 80,000+ cells efficiently
• Superior sensitivity
• Simple workflow
• Cell size flexibility, no lower limits
• Highest cell capture rates of up to 65%
• Low doublet rates of under 0.9% in 1,000 cells
• Available with Next GEM technology

이제 10x Genomics Chromium 시스템을 통해 Epigenome 정보를 단일세포 단위에서 연구할 수 있습니다. Chromium Single Cell ATAC Seq 을 이용하여 수 만개의 단일세포의 chromatin profiling 정보에 대한 고퀄리티의 동시비교분석이 가능하며, chromatin compaction과 DNA결합 단백질이 어떻게 유전자 발현을 조절하는지에 대한 고해상도 분석에 활용될 수 있습니다.

다른 application과 동일하게 10x Chromium의 Single Cell ATAC 솔루션은 단일 세포의 유전자 조절 네트워크를 정밀 분석하기위한 직관적 인 소프트웨어 및 시각화 도구가 함께 제공되고 있습니다.

Discover cellular heterogeneity stemming from epigenetic variability

Better understand the gene regulatory networks that are upstream of gene expression

Define cell types and states for lineage and developmental program tracing

Accelerate biomarker discovery

• Detect open chromatin regions in single cells with enriched signals in Transcription Start Sites (TSS) and regulatory regions
• Profile 500 to 10,000 nuclei per channel with our scalable, high-throughput solution
• Recover up to 65% of nuclei loaded on chips
• Investigate cell lines, primary cells, fresh, and cryopreserved samples with confidence
• Analyze your single cell epigenetic data with our turnkey analysis software and interactive visualization tools
• Available with Next GEM technology

단일세포 단위에서 chromatin 및 transcriptome profiling 정보를 동시에 얻을 수 있으며, 두 데이터 간의 상관관계를 분석하여 모든 세포에 대한 cell type, cell states과 유전자 조절 메커니즘을 더욱 심층적으로 연구할 수 있습니다.

• Download Product Sheet

Deeper characterization of cell types and states

Discover new gene regulatory interactions

Make the most of your precious samples

Explore disease complexity

조직 유형에 따른 맞춤형 프로토콜 없이 동결된 조직으로부터 간편하게 핵을 분리할 수 있습니다. Chromium gene expression, ATAC 및 Multiome gene expression 등의 분석에 함께 사용하도록 최적화된 시료 전처리 워크플로우를 제공합니다.

• Download Product Sheet

Deeper characterization of cell types and states

Discover new gene regulatory interactions

Make the most of your precious samples

Explore disease complexity

10x Genomics를 통해 제공되는 Visium Spatial Gene Expression은 온전한 조직 단면에 대한 형태학적 이미지에 전체 전사체 정보를 통합하여 발현된 유전자의 위치정보를 시각적으로 확인할 수 있는 솔루션이며, immunofluorescence 기술도 적용할 수 있습니다. 따라서, 한번의 실험으로 intact한 tissue section의 전체 부위를 대상으로 High-throughput mRNA sequencing 분석과 protein detection을 동시에 수행하여, tissue에 대해 보다 심층적인 정보를 얻을 수 있는 기술입니다.

• Download Product Sheet

Gain a complete view of disease complexity

Discover new biomarkers and identify novel cell types and states

Map the spatial organization of cell atlases

Identify spatiotemporal gene expression patterns

Protein Co-Detection

Immunofluorescence와 위치 정보를 가진 유전자 발현 정보를 결합하여 새로운 세포유형과 공간적 조직 정보를 발견할 수 있습니다.

• Download Product Sheet
• IF Demonstrated Protocol

10x Genomics에서 제공하는 Targeted Panel은 단일세포 또는 tissue에서 원하는 gene set에 대한 유전자 발현 분석이 가능한 기술입니다. Pan-Cancer, Immunology, Gene signature 그리고 Neuroscience 각 분야에서 많이 사용하는 gene set으로 이루어진 pre-designed panel과 원하는 gene으로 customization 할 수 있는 custom panel을 제공하고 있어, 절감된 비용으로 유전자 발현 분석 연구를 할 수 있습니다.

• Download Product Sheet

Accelerate translational research

Scale cellular screening

Refine discoveries

Validate biomarkers and drug targets

Visium Spatial Solutions를 통해 동일한 조직 단편에서 면역형광에 의해 단백질 검출과 함께 유전자 발현 공간 정보를 시각화할 수 있습니다. 전체 전사체 데이터에 훼손없이 샘플에서 희귀세포군의 위치정보, 면역세포 활성화 상태를 특성화하거나 온전한 조직에서 번역후 변형상태 및 세포 신호 과정등을 확인할 수 있습니다. Visium Spatial Gene Expression과 면역형광 워크플로우를 결합하면, 공간 전사체 기술을 조직 절편 및 면역형광 염색의 표준방법으로 쉽게 구현할 수 있습니다.

• Download Product Sheet

Single cell 수준에서의 유전자 발현 분석 연구시 가장 탄력적인 모델인 Chromium X Series는 연구 규모에 따라 다양하게 적용할 수 있습니다. 이번에 출시한 Chromium X Series는 파일럿 연구에서 대규모의 단일 세포 연구까지 확장하여 사용할 수 있습니다.
하나의 샘플에 대해 수백에서 수만 개의 단일세포를 분석할 수 있기에, 백만 개의 세포를 일상적으로 연구할 수 있습니다.

Product features

Next GEM 기술 기반의 모든 10x Genomics사의 application과 호환

연구 규모에 따라 LT에서 HT까지 다양하게 선택하여 사용

원터치 인터페이스 조작으로 사용자의 편의성을 높임

HT Kit 적용시, 채널 당 2만 ~ 6만 셀 분석 (16채널/chip)

대규모 연구시, 셀 당 running cost를 최대 70%까지 낮출 수 있음

처리량 증가와 유전자 및 단백질 발현량에 대한 다중체 판독이 진행되면서, 매우 희귀한 세포군 검출

• Download Brochure

Chromium Controller는 짧은 시간안에 약 8만개 이상의 단일세포를 바코드된 파티션으로 나누는 하드웨어로 10x Genomcis에서 제공하는 모든 Chromium single cell solution을 적용할 수 있게 제공합니다.

Product features

High-throughput analysis

Microfluidic 기반의 독자적인 Next GEM 기술을 이용한 high-throughput 분석 플랫폼으로 20분 안에 8개의 샘플을 분석할 수 있습니다.

Small footprint instrument

약 0.09 m2의 작은 크기의 기기로 모든 실험실에서 공간에 제한없이 쉽게 설치하여 사용할 수 있습니다.

Single Cell Solutions

• Single Cell Gene Expression
• Single Cell Immune Profiling
• Targeted Gene Expression
• Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression
• Single Cell ATAC

재현성 있는 Chromium Connect는 단일세포 수준으로 바코딩하는 과정부터 라이브러리 제작까지 최적화된 자동화 workflow로 이루어져, 대량의 single cell sequencing 결과를 얻을 수 있는 자동화 기기입니다. 자동화 시스템은 기존 단일세포 분석의 효율을 극대화하여 여러분의 연구의 가속화에 기여할 것입니다.

Product features

Generate Consistent Results

Reduce single cell data variability

Maximize Lab Productivity

Go from cells to sequencing-ready libraries

Integrated and Validated

Cell partitioning, barcoding, and library prep

• Download Brochure

일반 슬라이드에 놓인 조직의 전사체 분석 물질을 Visium 슬라이드로 이동

• Download Instrument Brochure
• More Information

Visium CytAssist를 이용하여 일반 슬라이드 위에 놓인 조직으로부터 전사체 분석 물질을 Visium 슬라이드로 이동

Visium 슬라이드에 직접 조직을 섹션하여 놓을 필요가 없으며, 일반 슬라이드에 있는 시료도 사용 가능하기에 샘플 이동에 용이

일반 조직학적 기술을 접목시켜 생물학적으로 가장 중요한 부분을 선별하여, Visium 실험 결과 극대화

CytAssist 전용 슬라이드와 시약을 사용하여 한 번에 2개의 FFPE 조직의 전사체 정보 분석

섹션된 조직의 무결성을 확인할 수 있으며, 조직의 형태를 미리 스크리닝하여 생물학적으로 중요한 영역 적용

단일세포 해상도로 발달, 질병, 유전자 기능 및 치료 반응의 복잡성 등을 연구할 수 있습니다. 단일세포 CRISPR 스크린을 통해 특정 CRISPR 기반 유전자 편집 또는 녹다운과 유전자 발현 및 세포 표면 단백질을 포함한 결과로 발생하는 변화된 표현형을 직접 판독할 수 있습니다.

• Download Product Sheet
• More Information

최대 수천 개의 CRISPR 기반 유전자 편집에 대한 단일세포 프로파일 분석으로 전체 유전자 네트워크, 주요 질병 경로 및 특정 유전자의 기능 규명

대규모 스크리닝을 통해 보다 많은 정보에 접근함으로써 정확한 약물 후보군 발굴

대부분의 CRISPR-Cas9 라이브러리 제품과 호환되어, 단일 세포 분석 과정을 간소화

전장유전체 연관분석(GWAS)의 히트수를 검증하고, CRISPR 편집을 통한 포괄적인 기능 정보를 얻어 유전자 기능을 이해

BEAM(Barcode Enabled Antigen Mapping)은 항원 특이적 B 세포(BEAM-Ab) 및 T 세포(BEAM-T) 클론형을 신속하게 검출할 수 있는 다중 항원 스크리닝 워크플로우입니다. 단일 세포 수준에서 full-length paired V(D)J 서열, 유전자 발현 및 세포 표면 단백질 등의 항원 특이적 세포 프로파일을 확보하여 희귀 항원 반응성 T 세포 및 B 세포를 식별합니다.

3' CellPlex는 multiplexing gene expression 연구에 적합한 솔루션입니다. Standard single cell gene expression을 사용하여 한 rxn으로 한 종류의 유전자 발현 프로파일링을 얻으셨다면, CellPlex 솔루션은 한 rxn 당 여러 시료를 multiplexing으로 분석할 수 있습니다.

• Download Product Sheet

Multiplex up to 12 samples per channel to increase sample throughput and reduce cost per sample

Capture up to 30,000 cells per channel to increase statistical power and resolve new cell types, subsets, and states

Leverage one solution for all samples, CellPlex is compatible across species and can be used with both cells and nuclei

Implement with confidence, relying on validated reagents, fully supported protocols, and integrated analysis software for robust multiplexing workflows in any study

Chromium Single Cell Low Throughput(LT) Gene Expression은 파일럿 테스트용으로 소량의 single cell을 이용하여 신속하게 데이터를 보고자 하는 분들이나, 처음 single cell 연구를 하고자 하는 분들 및 경제적인 비용으로 최적의 실험조건을 셋팅하고자 하는 분들께 권합니다.

• Download Product Sheet

Generate high-quality data for 100 to 1000 cells at a significantly lower up front cost

Optimize experimental conditions to maximize the success of your studies

Discover the most affordable and reliable way to get started with single cell gene expression using a proven technology

10x Genomics에서는 빠르고 효율적으로 Single Cell 연구를 도와 드리기 위해 Certified Service Provider Program을 운영하고 있습니다. 10x Genomics에서 인증한 CSP는 고도로 숙련된 연구진들로 구성되었으며, sample prep에서 라이브러리 구축 및 데이터 분석에 이르기까지 다양한 솔루션을 제공합니다.

DNA Link, Inc.

• Single Cell Gene Expression
• Single Cell Immune Profiling
• www.dnalink.com

Geninus

• Spatial Gene Expression Profiling
• www.geninus.com

Macrogen

• Single Cell Gene Expression
• Spatial Gene Expression Profiling
• www.macrogen.com