Chromium Single Cell V(D)J

Chromium Single Cell V(D)J

Immune cell 내 V(D)J transcripts에 10x barcode를 10만 개 이상 부여하여,
V(D)J transcripts에 대한 sequencing을 진행합니다.
Immune diversity와 관련이 있는 V(D)J gene의 full-length, expression level, adaptive immune system을
분석할 수 있습니다.

Features

  • 1 Chromium run으로 100~80,000 cells의 처리를 10분 이내에 완료
  • Cell capture rate : ~65% (기기에 사용한 cell 수 기준)
  • Doublet rate이 낮음 (1,000cell capture 시 0.9%)

Analysis software

  • CellRanger : Chromium Single cell V(D)J data 분석을 위한 total pipeline
  • Loupe V(D)J Browser : 분석이 완료된 data의 visualization tool

Analysis workflows