Chromium Genome

Chromium Genome

평균 길이가 50kbp 이상인 HMW gDNA에 100만 개 이상의 10x barcode를 붙인 뒤,
sequencing을 진행하여 linked-read를 생성합니다.
생성된 data로 보다 더 정확한 phasing, structural variant를 분석할 수 있습니다.

Features

  • 1ng의 gDNA로 high quality의 NGS library 구성
  • short read data로 long-range genome 분석
  • Megabase 수준의 phase 분석
  • large scale의 structural variation, translocation 분석
  • Turn-key 방식의 analysis pipeline과 visualization tool

Analysis software

  • LongRanger : Chromium Genome data 분석을 위한 total pipeline
  • Loupe Browser : 분석이 완료된 data의 visualization tool

Analysis workflows