Chromium Exome

Chromium Exome

평균 길이가 50kbp 이상인 HMW gDNA에 100만 개 이상의 10x barcode를 붙여 NGS library를 만든 뒤, exome region을 capture하여 sequencing을 진행하고, linked-read를 생성합니다.
Linked-read data를 사용하여 더 넓은 범위의 exome, complexity가 낮은 영역, repetitive region에 대해
분석할 수 있습니다.

Features

  • 1ng의 gDNA로 high quality의 NGS library 구성
  • Large scale의 structural variant 분석
  • Exome gene의 전체적인 phase variant 분석
  • high homology region 등의 분석이 어려웠던 region의 분석

Analysis software

  • LongRanger : Chromium Genome data 분석을 위한 total pipeline
  • Loupe Browser : 분석이 완료된 data의 visualization tool

Analysis workflows