Chromium De novo assembly

Chromium De novo assembly

평균 길이가 50kbp 이상인 HMW gDNA에 100만 개 이상의 10x barcode를 붙인 뒤,
sequencing을 진행하여 linked-read를 생성합니다.
Linked-read data로 true diploid assembly를 진행할 수 있으며, reference sequence 없이도
diploid genome structural 분석이 가능합니다.

Features

  • 1ng의 gDNA로 high quality의 NGS library 구성
  • True diploid assembly 분석
  • 수십 Megabase 수준의 scaffold size의 정확한 분석

Analysis software

  • Supernova : Chromium data의 de novo assembly를 위한 software

Analysis workflows